（記者 呂揚(yáng)）6月14日，國際著名期刊《自然》在線發(fā)表了中國科研團(tuán)隊(duì)最新成果——《基于36個(gè)族群的中國人泛基因組參考圖譜》。這標(biāo)志著由西安交通大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)等26家單位組成的科研團(tuán)隊(duì)經(jīng)過多年研究，在中國人群泛基因組領(lǐng)域取得重大成果。

人類參考基因組是廣泛用于人類遺傳學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的遺傳密碼“導(dǎo)航圖”，是解析人類起源與演化、揭示人類表型和疾病的物質(zhì)基礎(chǔ)。人類參考基因組經(jīng)歷了幾十次更新迭代，但無論是其初始計(jì)劃還是最新第38版（GRCh38），各參考基因組版本皆以白種人為主體而構(gòu)建，難以體現(xiàn)中國多族群的遺傳多樣性。即便是最新的旨在代表全人類遺傳多樣性的HPRC（人類泛基因組聯(lián)盟）項(xiàng)目，在其收集的全球46個(gè)樣本中也僅包含3個(gè)中國人樣本，無法代表14億中國人的遺傳多樣性。

因此，構(gòu)建能夠代表中華民族遺傳多樣性的中國人群泛基因組圖譜對中國人遺傳多樣性研究、復(fù)雜疾病分子機(jī)制研究和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)有重要意義。

2021年，西安交通大學(xué)聯(lián)合復(fù)旦大學(xué)等單位成立了中國人群泛基因組聯(lián)盟?？蒲袌F(tuán)隊(duì)采集了代表中國36個(gè)族群的58個(gè)樣本，采用最新的第三代高保真基因組測序技術(shù)對樣本進(jìn)行高深度測序，結(jié)合最新的單倍型基因組組裝方法，獲取了116個(gè)高質(zhì)量單倍型基因組，以圖基因組的方式構(gòu)建了中國人群參考泛基因組。相比于最新版的人類參考基因組，中國人群參考泛基因組發(fā)現(xiàn)了約1.9億個(gè)堿基的新序列，其中約500萬個(gè)堿基的新序列存在于95%以上單倍型中，體現(xiàn)了中國人群特異的遺傳圖譜。相比于HPRC項(xiàng)目構(gòu)建的人類參考泛基因組，中國人群參考泛基因組中新發(fā)現(xiàn)約580萬個(gè)小變異和3.4萬個(gè)結(jié)構(gòu)變異，其中約1.7萬個(gè)結(jié)構(gòu)變異影響6426個(gè)蛋白編碼基因，并且這些基因與人體免疫系統(tǒng)顯著相關(guān)。

團(tuán)隊(duì)通過研究中國人群泛基因組特異結(jié)構(gòu)變異在基因組上的分布，發(fā)現(xiàn)了與807個(gè)蛋白編碼基因相關(guān)的223個(gè)變異熱點(diǎn)區(qū)域，并且這些變異與東亞人群常見的尿石癥、腎結(jié)石、甲狀腺腫大等密切相關(guān)。此外，團(tuán)隊(duì)檢測出了較高比例的古人來源的新序列，為東亞現(xiàn)代人基因組中的古人基因滲入研究乃至整個(gè)古DNA領(lǐng)域提供了新線索。

“基于在基因組領(lǐng)域的研究基礎(chǔ)，我們研發(fā)了系列原創(chuàng)性基因組分析算法工具，用于中國人群泛基因組構(gòu)建及分析，打破了基因組領(lǐng)域前沿生物技術(shù)的國外壟斷，實(shí)現(xiàn)了我國在該領(lǐng)域從‘跟跑’到‘并跑’，甚至‘領(lǐng)跑’的轉(zhuǎn)變?！蔽靼步煌ù髮W(xué)副教授楊曉飛說。

“這項(xiàng)研究成果提升了我國在參考基因組領(lǐng)域的自主權(quán)，為完整構(gòu)建中華民族參考泛基因組奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)，為人類參考基因組繪制了獨(dú)特的中國畫卷?！蔽靼步煌ù髮W(xué)教授葉凱說。

西安交通大學(xué)教授施秉銀說：“中國人群泛基因組的成功構(gòu)建將解開此前制約我國‘精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)’發(fā)展的困局，提高我國醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)分析的完整性和準(zhǔn)確性，服務(wù)人民生命健康?！?/p>